Deteção de ortólogos e parálogos utilizando a árvore filogenética
| AUTHOR | Malhi, Manpreet Singh; Kaur, Sukhdeep |
| PUBLISHER | Edicoes Nosso Conhecimento (12/27/2024) |
| PRODUCT TYPE | Paperback (Paperback) |
Description
A ortologia e a paralogia são conceitos centrais na biologia evolutiva. A previsão de ortólogos (genes homólogos que divergiram devido à especiação) e paralólogos (genes homólogos que divergiram devido à duplicação) é parte integrante de muitos métodos de genómica comparativa. Existem vários métodos utilizados para inferir ortologia e paralogia. A ortologia e a paralogia podem ser inferidas utilizando métodos baseados em grafos e métodos filogenéticos. No entanto, o método baseado em análises filogenéticas assemelha-se muito à definição original de ortologia e paralogia e é conhecido por ser exato. No presente trabalho, é desenvolvido um pipeline para a deteção de ortólogos e paralólogos com base na abordagem filogenética. Um conjunto de proteínas foi descarregado do UniProt e foi criada uma base de dados. Foram detectados ortólogos e parálogos para a sequência de proteínas em causa. Foram utilizados o algoritmo de sobreposição de espécies e o limiar de distância patrística entre pares para identificar a previsão exacta e ajustada de parálogos e ortólogos. Foi desenvolvida uma interface amigável para facilitar a utilização.
Show More
Product Format
Product Details
ISBN-13:
9786208405762
ISBN-10:
6208405769
Binding:
Paperback or Softback (Trade Paperback (Us))
Content Language:
Portuguese
More Product Details
Page Count:
60
Carton Quantity:
118
Product Dimensions:
6.00 x 0.14 x 9.00 inches
Weight:
0.22 pound(s)
Country of Origin:
US
Subject Information
BISAC Categories
Science | Life Sciences - Botany
Descriptions, Reviews, Etc.
publisher marketing
A ortologia e a paralogia são conceitos centrais na biologia evolutiva. A previsão de ortólogos (genes homólogos que divergiram devido à especiação) e paralólogos (genes homólogos que divergiram devido à duplicação) é parte integrante de muitos métodos de genómica comparativa. Existem vários métodos utilizados para inferir ortologia e paralogia. A ortologia e a paralogia podem ser inferidas utilizando métodos baseados em grafos e métodos filogenéticos. No entanto, o método baseado em análises filogenéticas assemelha-se muito à definição original de ortologia e paralogia e é conhecido por ser exato. No presente trabalho, é desenvolvido um pipeline para a deteção de ortólogos e paralólogos com base na abordagem filogenética. Um conjunto de proteínas foi descarregado do UniProt e foi criada uma base de dados. Foram detectados ortólogos e parálogos para a sequência de proteínas em causa. Foram utilizados o algoritmo de sobreposição de espécies e o limiar de distância patrística entre pares para identificar a previsão exacta e ajustada de parálogos e ortólogos. Foi desenvolvida uma interface amigável para facilitar a utilização.
Show More
List Price $37.00
Your Price
$36.63
